В истории Mercedes-Benz 600 (W100) отдельно стоит отметить три автомобиля, выпущенные в единственном экземпляре и выделяющиеся особой эксклюзивностью даже на фоне остальных, далеко не массовых, «шестисотых».
Первым из них стало двухдверное купе, построенное в августе 1965 года и впоследствии подаренное шеф-дизайнеру Рудольфу Уленхауту при его выходе на пенсию. Автомобиль, по сравнению с базовым седаном, имел укороченную на 220 мм. колесную базу. Характерной деталью Mercedes-Benz 600 Coupe, не встречающейся на других моделях серии W100, стали «жабры» на передних крыльях в стиле 300SL. В некоторых источниках упоминаются и другие купе серии W100, но они являются переделками из седанов силами тюнинг-ателье или частных умельцев и не имеют прямого отношения к продукции Daimler-Benz. Оригинальный экземпляр был окрашен в глубокий тёмно-вишневый цвет.
Практически одновременно с версией купе, в сентябре 1965 года, увидел свет эксклюзивный Mercedes-Benz 600 Pullman Landaulet, изготовленный для Папы Павла VI. На тот момент Daimler-Benz уже имел давнюю историю постройки автомобилей для Ватикана. От стандартного 4-х дверного Pullman Landaulet этот автомобиль отличался увеличенной высотой крыши, что позволило поднять уровень пола в салоне понтифика над центральным тоннелем; компоновкой задней части салона с расположенным по центру креслом, вместо заднего дивана; задними дверями увеличенного размера, установленными непосредственно за передними дверями, без промежуточной вставки. Автомобиль находился на службе Ватикана на протяжении 20 лет, после чего, в 1985 году, был передан в музей Daimler-Benz. В 2011 году этот Mercedes-Benz 600 Pullman Landaulet получил первый приз на автомобильном конкурсе элегантности, проходившем с 11 по 13 марта во Флориде.
Последним штучным W100 стал Mercedes-Benz 600 Landaulet построенный на стандартной базе 3200 мм. по заказу немецкого аристократа Графа Филиппа-Константина фон Беркхайма в мае 1967 года. Фон Беркхайм был частично парализован после аварии 1956 года, в которую он попал на своем Mercedes-Benz 300SL, но будучи в прошлом автогонщиком, заказчик хотел иметь возможность самостоятельно управлять своим «шестисотым». Для этого автомобиль оснастили ручным управлением. По некоторым данным стоимость эксклюзивного W100 вдвое превышала стоимость Пульмана. В настоящий момент автомобиль продолжает оставаться в собственности семьи фон Беркхаймов, но за его состоянием следит один из клубов любителей олдтаймеров.
