Дрелью очень легко повредить модель, я бы не стал рисковать. А рукой 1-мм сверлом нетрудно, и безопасно. Главное очень точно наметить центры будущих отверстий, ровно, симметрично и точно по размеру стоек кенгурятника, и наколоть чуть-чуть шилом, чтобы сверло в начале работы не ушло в сторону.
Если отверстия будут совпадать с диаметром стоек, то клея надо совсем чуть. Но не забудьте сделать стойки немного длиннее, на глубину отверстий.
Чем красить? Взять два кусочка пластика, один покрасить краской, другой маркером, дать высохнуть и выбрать лучщий вариант. Все просто